不良事件发生率约为6.2%，主要表现为恶心、腹泻、头晕和血清转氨酶增高。国内进行的阿比多尔制剂的人体生物等效性试验中，服药3小时后部分健康受试者出现心动过缓的情况（心率小于60次/分，且心率降低在2-24次/分间），受试者无不良症状。此事件与药物的相关性尚不明确。

孕妇及哺乳期妇女、严重肾功能不全者慎用或遵医嘱。琦效盐酸阿比多尔片对于有窦房结病变或功能不全的患者的意义尚不明确，建议该类人群服用本品慎重考虑。