不良反应的评估基于下列频率数据： 十分常见：≥10% 常见：≥1%-＜10% 偶见：≥0.1%-＜1% 罕见：≥0.01%-＜0.1% 十分罕见：＜0.01%或现有数据无法评估 胃肠道紊乱： 临床试验中，用熊去氧胆酸进行治疗时稀便或腹泻的报告常见。 在治疗原发性胆汁性肝硬化时，发生严重的右上腹疼痛十分罕见。 肝胆功能紊乱： 用熊去氧胆酸进行治疗时，发生胆结石钙化的病例十分罕见。 治疗晚期原发性胆汁性肝硬化时，发生肝硬化失代偿的情形十分罕见，停止治疗后部分恢复。 过敏反应： 发生荨麻疹十分罕见。

熊去氧胆酸胶囊必须在医生监督下使用。 主治医师在治疗前三个月必须每4周检查一次患者的一些肝功能指标如AST（SGOT）、ALT（SGPT）和γ-GT等，并且以后每3个月检查一次肝功能指标。除可以在原发性胆汁性肝硬化患者中鉴别应答者或非应答者，此检查也可早期检查出潜在的肝功能恶化，特别是对晚期的原发性胆汁肝硬化患者。 用于溶解胆固醇结石时，为了评价治疗效果，及早发现胆结石钙化，应根据结石大小，在治疗开始后6~10个月，做胆囊Χ射线检查（口服胆囊造影）。于站立位及躺卧位（超声监测）拍Χ射线照片。