在卡培他滨针对不同适应证进行单药治疗（结肠癌辅助治疗，转移性结肠癌和转移性乳腺癌治疗）和进行联合化疗方案是都有可能发生不良反应。根据7项临床试验集中分析所得出的最高发生率，将各种不良反应归入以下表格中的相应分类中。各频率分类中，不良反应按 严重程度由重到轻排列，频率分为非常常见（大于等于1/10）、常见（≥5/100和）和不常见（≥1/1000-＜1/100）。卡培他滨单药治疗-关于卡培他滨单药治疗安全性的资料来自国外对结肠癌辅助 治疗和转移性乳腺癌或转移性结直肠癌治疗患者的报告，安全性信息包括1项结肠癌辅助治疗III期试验、4项女性乳腺癌II期试验及3项男女结肠癌试验的资料。卡培他滨单药治疗的安全性在结肠癌辅助治疗患者中与转移性乳腺癌或转移性结直肠癌治疗患者相似。不良反应的强度分级依据NCIC CTC分级系统的毒性分级。

腹泻：卡培他滨可引起腹泻，有时比较严重，对于出现严重浮现的患者应给予密切监护，若患者开始出现脱水，应立即补充液体和电解质。在适当的情况下，应及早开始适用标准止泻治疗药物，必要时需降低给药剂量。 脱水：必须预防脱水，并且在脱水出现时及时纠正 。病人出现厌食、虚弱、恶心、呕吐或腹泻时早起即可出现脱水。当出现2级（或以上）脱水症状时，必须立即停止本品的治疗，同时纠正脱水，知道病人脱水症状消失，且导致脱水的直接原因被纠正控制后，才可以重新开始本品治疗。针对不良事件调整给药剂量是必要的。已观察到的卡培他滨的心脏毒性与氟尿嘧啶药物类似，包括心肌梗死。新绞痛、心律不齐、心脏停搏、心功能衰竭和心电图改变，既往有冠状动脉疾病史的患者中这些不良事件可能更常见。吉王后幼因二氢嘧啶脱氢酶缺乏引起的5-氟尿嘧啶 相关罕见、难以预料的 严重毒性发生，因此无法排除DPD水平降低与5-氟尿嘧啶潜在致死毒性效应增强之间存在关联的可能。